Innenfilter werden komplett innerhalb des Aquariums angebracht, womit das Risiko von Undichtigkeiten minimiert wird. Gerade bei kleinen bis mittleren Aquarien ist der Innenfilter häufig eine gute Wahl. Die meisten Innenfilter zeichnen sich auch durch Ihren geringen Stromverbrauch aus, wodurch ihr Betrieb eine zumeist kostengünstige Art der Filterung darstellt.